Le Programme USEP s'exécute sur le terrain sur la base d'un Protocole d'Accord entre le FNE et les Collectivités Locales. Son pilotage s'appuie sur le partenariat avec les institutions suivantes:

• - Ministère de l'Emploi et de la Formation Professionnelle (MINEFOP) ;
• - Ministère de l'Habitat et du Développement Urbain (MINHDU);
• - Ministère de l'Economie, de la Planification et de l'Aménagement du Territoire (MINEPAT);
• - Ministère de l'Administration Territoriale et de la Décentralisation (MINATD) ;
• - Ministère des Travaux Publics (MINTP) ;
• - Ministère de la Forêt et de la Faune (MINFOF) ;
• - Bureau International du Travail (BIT) ; et
• - Toute autre institution susceptible d'apporter sa contribution pour le développement du Programme.